تم بناء مختبر مستشفى جم في ثلاثة أقسام ، تقع إدارة المختبر وأخذ العينات ودورات المیاه في الطابق الأرضي أسفل الممر المؤدي إلى موقف السيارات ، ويمكن الوصول إليها من مدخل المستشفى وموقف السيارات لسهولة الاستخدام . يقع القسم الفني للمختبر في وسط الطابق الأول ، والذي یشمل أقسام الكيمياء الحيوية ، والهرمونات ، وأمراض الدم ، والأحياء الدقيقة ، والأمصال والتخثر ، والمناعة ، والبول والطفيليات والتشخيص الجزيئي. يقع قسم علم الأمراض في مختبر مستشفى جم أسفل الطابق الأرضي.
تم إنشاء مختبر الأمراض في مستشفى جم عام 1970م. في عام 2011م تم توسيع مبنى المختبر وأضيفت وحدة الأمراض إلى مختبر مستشفى جم في عام 2015م. يفخر مختبر علم الأمراض في مستشفى جم بإجراء اختبارات عالیة الجودة للمرضى في أسرع وقت ممكن.